Die Gemeinschaft der Mikroorganismen im menschlichen Darmmikrobiom kann durch Ernährungsumstellung, Infektionen und vor allem Antibiotika aus dem Gleichgewicht geraten. Die vielfältigen mikrobiellen Adaptations- und Resistenzmechanismen – insbesondere die evolutionäre Weiterentwicklung einzelner Bakterienpopulationen durch Selektion antibiotikaresistenter Varianten – sowie ihre Auswirkungen auf die Ökologie und Resilienz der mikrobiellen Gemeinschaft wurden in einer großangelegten metagenomischen Studie erforscht.